ผู้พัฒนาโครงการฝ่ายไทยมีหน้าที่ติดตั้งเครื่องจักร อุปกรณ์ ดำเนินโครงการ และตรวจวัดค่าของพารามิเตอร์ตามที่ระเบียบวิธีการลดก๊าซเรือนกระจกที่เลือกใช้กำหนด เช่น โครงการผลิตพลังงานไฟฟ้าจากพลังงานแสงอาทิตย์ต้องตรวจวัดปริมาณพลังงานไฟฟ้าที่ผลิตได้ตลอดอายุโครงการเป็นเวลา 10-17 ปี
ส่วนผู้พัฒนาโครงการฝ่ายญี่ปุ่นมีหน้าที่บริหารโครงการและรายงานผลการตรวจวัดค่าของพารามิเตอร์ให้กับ Global Environment Centre Foundation (GEC) และจัดส่งเอกสารข้อเสนอโครงการและแผนการติดตามประเมินผลเพื่อขอขึ้นทะเบียนโครงการที่ได้รับการตรวจสอบความใช้ได้ (validation) ไปยังฝ่ายเลขานุการฯ เพื่อขอขึ้นทะเบียนโครงการ
หลังจากที่โครงการได้รับการขึ้นทะเบียนแล้ว ผู้พัฒนาโครงการทั้งสองฝ่ายเปิดบัญชีในระบบทะเบียน โดยผู้พัฒนาโครงการฝ่ายญี่ปุ่นเปิดบัญชีในระบบทะเบียนของฝ่ายญี่ปุ่น ส่วนผู้พัฒนาโครงการฝ่ายไทยเปิดบัญชีในระบบทะเบียนขององค์การบริหารจัดการก๊าซเรือนกระจก
ผู้พัฒนาโครงการฝ่ายไทยต้องบันทึกค่าของพารามิเตอร์ที่ตรวจวัดในแผ่นงานของไฟล์แผนงานการติดตามประเมินผลโครงการที่ได้รับการขึ้นทะเบียนเพื่อจัดทำรายงานการติดตามประเมินผลโครงการ นับตั้งแต่วันที่เริ่มดำเนินโครงการตามที่ระบุในเอกสารข้อเสนอโครงการ
ผู้พัฒนาโครงการฝ่ายญี่ปุ่นต้องยื่นคำขอรับการรับรองปริมาณคาร์บอนเครดิตพร้อมทั้งรายงานการติดตามประเมินผลโครงการที่ผ่านการทวนสอบความถูกต้องจากผู้ตรวจประเมินโครงการ (verified monitoring report) และรายงานการทวนสอบความถูกต้อง (verification report) ไปยังฝ่ายเลขานุการของกลไก JCM เพื่อขอรับรองคาร์บอนเครดิต
ทั้งนี้ผู้พัฒนาโครงการฝ่ายไทยและฝ่ายญี่ปุ่นต้องให้ข้อมูลที่จำเป็นแก่ที่ปรึกษาโครงการและผู้ตรวจสอบประเมินโครงการในขั้นตอนการตรวจสอบความใช้ได้ (validation) และการทวนสอบความถูกต้อง (verification)