การคัดเลือกโครงการที่จะให้ทุนพิจารณาหลักเกณฑ์ซึ่งมี 2 ลักษณะ คือ ผ่าน/ไม่ผ่าน และการให้คะแนนมาก/น้อย โดยพิจารณาความเป็นไปได้ที่ผู้พัฒนาโครงการจะสามารถพัฒนาโครงการได้สำเร็จและทำให้เกิดการลดการปล่อยก๊าซเรือนกระจกได้ตามที่คาดการณ์ไว้ เช่น มีแผนงานที่ชัดเจน มีความน่าเชื่อถือ สามารถดำเนินโครงการได้โดยไม่มีความเสี่ยง (ตัวอย่างความเสี่ยง เช่น ความไม่แน่นอนของกำลังการผลิตของอุตสาหกรรมบางประเภท) นอกจากนี้ยังพิจารณาความคุ้มค่าในการให้การสนับสนุนซึ่งคำนวณได้จากปริมาณเงินสนับสนุนต่อปริมาณก๊าซเรือนกระจกที่ลดได้ (เยน/ตันคาร์บอนไดออกไซด์เทียบเท่า)